Analisis Metagenomik Bakteri (NGS)

Course Overview

Spesifikasi laptop untuk mengikuti topik ini minimal menggunakan core i5 atau ryzen 5 dan RAM paling kecil 4 gb

Sub-topics

• 1.
  Spesifikasi laptop untuk mengikuti topik ini minimal menggunakan core i5 atau ryzen 5 dan RAM paling kecil 4 gb

• 2.
  Mengenal platform NGS dan Mampu menjalankan virtual linux

• 3.
  Mengenal database, gene bank untuk analisis NGS dan Mampu mengoperasikan terminal linux

• 4.
  Memahami fungsi masing - masing tools dalam pipeline dan Mampu memproses data mentah Illumina

• 5.
  Mampu memproses data mentah Illumina (lanjutan)

• 6.
  Mengenal bahasa pemrograman R, Mampu mengoperasikan R melalui Rstudio dan Mampu menganalisis data biom menggunakan R

• 7.
  Mampu olah data sekuen mandiri

Course Components