Computational Pharmacology (Bundling 3 Kelas)
-
Course Overview
Bundling kelas ini dirancang untuk memberikan pemahaman komprehensif tentang bagaimana data genomik, jaringan biologis, dan simulasi molekul dapat digunakan untuk memprediksi respons obat, menganalisis mekanisme aksi, hingga mengungkap dasar resistansi obat. Peserta akan mempelajari alur kerja komputasional yang saling terhubung—mulai dari level gen hingga dinamika protein–ligan.
Sub-topics
- 1.Next-Generation Sequencing for Pharmacogenomics
Pelajari bagaimana variasi genetik memengaruhi respons terhadap obat melalui teknologi NGS. Topik mencakup: Prinsip dasar NGS dan farmakogenomik, Gen penentu respons obat & panel PGx, Workflow eksperimen dan bioinformatika (alignment, variant calling, QC), Identifikasi varian yang relevan secara klinis, Konversi data NGS menjadi laporan farmakogenomik yang dapat digunakan secara praktis
- 2.Network Pharmacology for Drug–Target–Pathway Analysis
Pahami bagaimana obat bekerja dalam konteks sistem biologis yang kompleks. Topik mencakup: Konsep dan peran network pharmacology, Integrasi multi-omics dan multi-database, Analisis PPI, centrality, dan clustering, Functional enrichment (GO/KEGG), Integrasi ekspresi gen (GEO), Penyusunan model drug–target–pathway untuk memetakan mekanisme molekuler
- 3.Investigating Drug Resistance via Docking & Molecular Dynamics
Eksplorasi bagaimana mutasi protein target dapat memengaruhi binding obat melalui pendekatan struktur molekul. Topik mencakup: Mekanisme farmakologis resistansi obat, Identifikasi mutasi kritis pada protein target, Molecular docking untuk melihat perubahan interaksi, Molecular dynamics simulation untuk menilai stabilitas kompleks, Free energy analysis (MM/PBSA), Translasi hasil simulasi menjadi insight farmakologi