Investigating Drug Resistance via Docking & Molecular Dynamics

Course Overview

Kursus ini dirancang untuk membekali peserta dengan pemahaman komprehensif mengenai mekanisme resistansi obat dari perspektif struktural dan komputasional. Melalui integrasi docking, dinamika molekuler, serta analisis energi bebas, peserta akan mampu mengevaluasi bagaimana mutasi pada target obat dapat mengubah afinitas ikatan dan efektivitas farmakologis.

Sub-topics

• 1.
  Pharmacological Basis of Drug Resistance Mechanisms

  Memahami konsep dasar resistansi obat, mekanisme molekuler, dan implikasinya terhadap efektivitas terapi.

• 2.
  Mutation Identification in Drug Target Proteins

  Menyelidiki mutasi kritis yang memengaruhi interaksi obat–target dan menginisiasi resistansi.

• 3.
  Molecular Docking for Drug–Target Interaction Analysis

  Memprediksi mode ikatan obat, perubahan afinitas akibat mutasi, serta penilaian pose terbaik.

• 4.
  Molecular Dynamics Simulation

  Mengevaluasi stabilitas kompleks obat–target dalam kondisi dinamis dan lingkungan biologis realistis.

• 5.
  Free Energy Calculations (MM/PBSA)

  Menghitung energi bebas ikatan untuk menilai dampak mutasi terhadap kekuatan interaksi obat.

• 6.
  Translating Simulation Findings into Pharmacological Insight

  Menghubungkan hasil simulasi dengan makna farmakologis, termasuk prediksi resistansi dan rekomendasi desain obat.

Course Components